Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPGS1Q6ZTW0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPGS1Q6ZTW0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms