Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms