Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms