Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms