Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms