Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms