Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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