Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIF1Q5UIP0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms