Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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