Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LDLRAP1Q5SW96 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms