Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms