Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms