Protein–RNA interactions for Protein: Q52M75

LINC01554, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01554, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01554Q52M75 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01554Q52M75 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms