Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFB133Q30KQ1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms