Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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