Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms