Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms