Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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