Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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