Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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