Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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