Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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