Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCLAFQ15004 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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