Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SEMA3AQ14563 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SEMA3AQ14563 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SEMA3AQ14563 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SEMA3AQ14563 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SEMA3AQ14563 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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