Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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UBE4AQ14139 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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