Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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