Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDRQ13258 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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