Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NR1H3Q13133 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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