Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms