Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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