Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXD4Q12950 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXD4Q12950 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXD4Q12950 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXD4Q12950 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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