Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFCP2Q12800 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFCP2Q12800 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms