Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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