Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms