Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms