Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms