Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms