Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME1Q06323 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms