Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms