Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms