Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RELAQ04206 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RELAQ04206 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RELAQ04206 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RELAQ04206 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms