Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms