Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP27A1Q02318 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms