Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B2Q01814 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B2Q01814 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms