Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDM2Q00987 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms