Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms