Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms