Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO4P61968 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms