Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms