Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms